** 実行時のスクリーンショット
*** c60を四つ生成した様子
Two visualizers for hierarchical graph rewriting are available;
[[UNYO-UNYO:http://www.ueda.info.waseda.ac.jp/~wakako/wiki/index.php?UNYO-UNYO]] (in Japanese) and Graphene.~
//English version of the UNYO-UNYO 3G info will be available below shortly.
The basic information of UNYO-UNYO (sometimes called UNYO-UNYO 3G) is given below.
*UNYO-UNYO [#a8a84841]
**Basic Operations [#j8daaada]
***''Step 1'': Start - Select a program [#lf57db2c]

起動後、Go aheadを連打し、Heatuoを一回行った結果。手動でのほぐし作業は全く行っていません。膜は見やすい位置に移動しました。
''Using UNYO-UNYO alone''
+Start up UNYO-UNYO (see [[UNYO-UNYO]]).
+Choose '''"File > Open File"''' in the top menu bar.
+Select LMNtal execution options.
+Select a program which you want to open.

*** 26本の多重リンクをした様子
''Using UNYO-UNYO from [[LaViT>http://www.ueda.info.waseda.ac.jp/lmntal/lavit/index.php?Download]]''
+Start up LaViT.
+Choose '''"File > Open File"''' in the top menu bar or Write a program using the editor in the upper-left pane of the screen.
+Select LMNtal execution options from the option tab, if you need.
+Click the '''"UNYO(3G)"''' button in the bottom left of the screen, and UNYO-UNYO will start up.

*** 26本の自己リンクをした様子
***''Step 2'': Show the graph of the program [#z6afe9c1]
+After ''Step 1'', the initial state of the graph is displayed.
+Click the '''"Go Ahead"''' button at the bottom of the center panel, then a program will proceed.
--In the text box at the left, you can specify the number of rule applicable times.(default number is 1)
--If you select the '''"Until Stop"''' checkbox, the program proceed until it terminate, or you click the "Stop" button, or it break at the breakpoint.

** 操作説明
*** メインパネル(一番大きいパネル)
- Ctrlを押しながら膜をクリックすると表示、非表示を切替えられる
- ダブルクリックでノード(アトムや膜)の固定、開放を切替えらる
-- 固定されたものは、力学モデル計算による移動を一切行わない
-- 固定されたノードでも、周囲への力学的影響は与える
-- アトムをダブルクリックでアトムの固定
-- 非表示の膜をダブルクリックで膜の固定
--- 膜の中のノードも固定されるため、表示設定にしたときには中のノードも固定されている
-- 表示の膜をダブルクリックで膜に含まれるノードを全て固定
- ドラッグでノードの移動が行える
-- ドラッグ中のノードは力学的影響を受けない
- なにもない部分をドラッグすると全体を移動する
*** ログパネル(下部のパネル)
**Function List [#jb6fc82e]
***1: Menu Bar [#z9cd180e]
:''Open File(Ctrl+O):''| open a program file.
:''Save Graph Image(Ctrl+I):''|

*** コントロールパネル(右のパネル)
- Go aheadで反応を進める
- Show Allで全ての膜を表示設定にする
- Hide Allで全ての膜を非表示設定にする
- Divergenceで所属膜の中心から反発する力を受ける
-- 世界膜からも影響を受けるため、膜に所属していないノードも影響を受ける
-- 実行中は残り実行時間を左上に表示する
-- 実行するたびに実行時間が100ずつ加算される。
--- 100は100ステップの意味
-- 実行中もAttraction(引力)以外の力学的影響を受ける
--- より発散させたい場合は他の力学モデルの計算を切った方が良い
- Stop Divergenceで発散処理を打ち切る
- Show Link Numberにチェックが入っていると、リンクの引数番号が表示される
- Calc Angleにチェックが入っていると角解像度(最小の角度)を大きくする力を加える
- Calc Springにチェックが入っているとバネモデルの力をリンクに持たせる
- Calc Replusiveにチェックが入っていると、各ノードが重ならないように力を加える
- Calc Attractionにチェックが入っていると、所属膜の中心と弱いバネで結び引力を加わえる
- スライダーで拡大縮小を行う
''Edit:'' now being developed...

''Zoom(Scroll wheel, Ctrl++(;), Ctrl+-):'' change the scale of the graph.

:''Show Map(Ctrl+M):''|show the whole graph.
:''Monochrome Display:''|
:''Show Full Name:''|show full name of atoms or membranes.
:''Show Initials:''|show initials of atoms or membranes.
:''Hide Name:''|hide name of atoms or membranes.
:''Show Reaction Point:''|show reaction points of the graph.
:''Show Link Number:''|
:''Info Font Size:''|

***2: Graph Controller [#naa78501]
:''Until Stop:''|make the program proceed until it terminate, or is suspended by '''"Stop"''' button, or break at a breakpoint.
:''Go Ahead:''|perform one-step reduction by default. For multi-step reductions, change the number in the text box to the left.
:''Stop:''|suspend the running program.
:''Hide All:''|hide the contents of all cells.
:''Show All:''|show the contents of all cells.
:''Always Heating Up:''|always calculate the graph layout.
:''Heating Up:''|activate the stable state nodes temporarily, and restart calculating those layout.
:''Cool Down:''|inactivate nodes, and terminate calculating layout.
:''Auto Centering:''|move the whole graph in the center of the Graph Panel.

***3: Tab Panel [#p6fe0100]
:''Log:''|show the system log.
:''Process:''|show the text representation of the graph and the applied rule. 
:''Rule:''|show the rules in the membrane you click.
:''Option:''|change the graph layout algorithm.
:''Shape:''|change the shapes of atoms.
:''Breakpoint:''|set breakpoints.
:''Search:''|search nodes in the Graph Panel.

***4: Graph Panel [#q1f93242]
:''Drag:''|move the selected nodes.
:''Click:''|select a node, if it is at the point.~
:''Ctrl+Click:''|select/unselect the nodes.~
:''Ctrl+A:''|select all of the nodes.~
:''Shift+Drag:''|select/unselect the nodes in the framed rectangle by dragging.~
:''Space+Drag:''|move the graph.~
:''Double-Click:''|hide/show the contents of the double-clicked cell.
::''Hold:''|pin down the selected nodes.(Pinned-down entities can be moved manually but will not move automatically)~
::''Release:''|release the pinned-down nodes.~
::''Ravel Out:''|exert repulsive force from the center of the connected component which contains selected nodes.~

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