（８３）Ｑｕｉｘｏｔｅを用いた蛋白質特徴知識ベースと検索システム 


	マ シ ン：PIM
	環　　境：PIMOS
	言　　語：KL1
	ソース量：280 KB
	文　　書：ユーザーズマニュアル (日本語/英語)

概要

知識表現言語Quixoteを用いた蛋白質のモチーフのデータベース

特徴

機能

蛋白質の一次構造はアミノ酸の配列であらわされ、その配列中で特定の蛋白質 に特徴的な部分をモチーフと呼ぶ。多くの場合モチーフは蛋白質の機能部位で あり、生物学的に重要な意味を持っている。世界的に有名な蛋白質のモチーフ のデータベースにはPrositeがあるが、本プログラムはProsite(Rel.9.0)のデー タを蛋白質の種類、機能に基づいて分類し、階層化してQuixoteで記述したも のである。蛋白質のモチーフをオブジェクトとして表現し、蛋白質の機能に従っ てクラス分けを行い、階層関係を記述した。さらにモチーフの性質に従ってオ ブジェクト群をモジュールに分割し、モジュール間関係を記述してルールの継 承関係を明示している。特定の蛋白質のモチーフについて、Quixoteのモジュー ルおよび継承機構を用いて、生物学的に関連のあるモチーフについての情報を 効率的に得ることが可能である。

ＦＴＰ

www-admin@icot.or.jp