Backup diff of Visualizer vs current(No. 1)

The added line is THIS COLOR.
The deleted line is THIS COLOR.
[[MenuBar]]
#author("2019-04-29T17:09:14+09:00","default:LMNtal","LMNtal")
//[[Documentation]]

** &#23455;&#34892;&#26178;&#12398;&#12473;&#12463;&#12522;&#12540;&#12531;&#12471;&#12519;&#12483;&#12488;
*** c60&#12434;&#22235;&#12388;&#29983;&#25104;&#12375;&#12383;&#27096;&#23376;
&ref(unyounyo061206.png);
Two visualizers for hierarchical graph rewriting are available;
[[UNYO-UNYO:http://www.ueda.info.waseda.ac.jp/~wakako/wiki/index.php?UNYO-UNYO]] (in Japanese) and Graphene.~
//English version of the UNYO-UNYO 3G info will be available below shortly.
The basic information of UNYO-UNYO (sometimes called UNYO-UNYO 3G) is given below.
*UNYO-UNYO [#a8a84841]
#contents
**Basic Operations [#j8daaada]
***''Step 1'': Start - Select a program [#lf57db2c]

&#36215;&#21205;&#24460;&#12289;Go ahead&#12434;&#36899;&#25171;&#12375;&#12289;Heatuo&#12434;&#19968;&#22238;&#34892;&#12387;&#12383;&#32080;&#26524;&#12290;&#25163;&#21205;&#12391;&#12398;&#12411;&#12368;&#12375;&#20316;&#26989;&#12399;&#20840;&#12367;&#34892;&#12387;&#12390;&#12356;&#12414;&#12379;&#12435;&#12290;&#33180;&#12399;&#35211;&#12420;&#12377;&#12356;&#20301;&#32622;&#12395;&#31227;&#21205;&#12375;&#12414;&#12375;&#12383;&#12290;
''Using UNYO-UNYO alone''
+Start up UNYO-UNYO (see [[UNYO-UNYO]]).
+Choose '''"File > Open File"''' in the top menu bar.
+Select LMNtal execution options.
+Select a program which you want to open.

*** 26&#26412;&#12398;&#22810;&#37325;&#12522;&#12531;&#12463;&#12434;&#12375;&#12383;&#27096;&#23376;
&ref(unyounyo061209.png);
''Using UNYO-UNYO from [[LaViT>http://www.ueda.info.waseda.ac.jp/lmntal/lavit/index.php?Download]]''
+Start up LaViT.
+Choose '''"File > Open File"''' in the top menu bar or Write a program using the editor in the upper-left pane of the screen.
+Select LMNtal execution options from the option tab, if you need.
+Click the '''"UNYO(3G)"''' button in the bottom left of the screen, and UNYO-UNYO will start up.

*** 26&#26412;&#12398;&#33258;&#24049;&#12522;&#12531;&#12463;&#12434;&#12375;&#12383;&#27096;&#23376;
&ref(unyounyo061210.png);
***''Step 2'': Show the graph of the program [#z6afe9c1]
+After ''Step 1'', the initial state of the graph is displayed.
+Click the '''"Go Ahead"''' button at the bottom of the center panel, then a program will proceed.
--In the text box at the left, you can specify the number of rule applicable times.(default number is 1)
--If you select the '''"Until Stop"''' checkbox, the program proceed until it terminate, or you click the "Stop" button, or it break at the breakpoint.

** &#25805;&#20316;&#35500;&#26126;
*** &#12513;&#12452;&#12531;&#12497;&#12493;&#12523;&#65288;&#19968;&#30058;&#22823;&#12365;&#12356;&#12497;&#12493;&#12523;&#65289;
&#20027;&#12395;&#12450;&#12488;&#12512;&#12420;&#33180;&#12364;&#25551;&#30011;&#12373;&#12428;&#12414;&#12377;
- Ctrl&#12434;&#25276;&#12375;&#12394;&#12364;&#12425;&#33180;&#12434;&#12463;&#12522;&#12483;&#12463;&#12377;&#12427;&#12392;&#34920;&#31034;&#12289;&#38750;&#34920;&#31034;&#12434;&#20999;&#26367;&#12360;&#12425;&#12428;&#12427;
- &#12480;&#12502;&#12523;&#12463;&#12522;&#12483;&#12463;&#12391;&#12494;&#12540;&#12489;&#65288;&#12450;&#12488;&#12512;&#12420;&#33180;&#65289;&#12398;&#22266;&#23450;&#12289;&#38283;&#25918;&#12434;&#20999;&#26367;&#12360;&#12425;&#12427;
-- &#22266;&#23450;&#12373;&#12428;&#12383;&#12418;&#12398;&#12399;&#12289;&#21147;&#23398;&#12514;&#12487;&#12523;&#35336;&#31639;&#12395;&#12424;&#12427;&#31227;&#21205;&#12434;&#19968;&#20999;&#34892;&#12431;&#12394;&#12356;
-- &#22266;&#23450;&#12373;&#12428;&#12383;&#12494;&#12540;&#12489;&#12391;&#12418;&#12289;&#21608;&#22258;&#12408;&#12398;&#21147;&#23398;&#30340;&#24433;&#38911;&#12399;&#19982;&#12360;&#12427;
-- &#12450;&#12488;&#12512;&#12434;&#12480;&#12502;&#12523;&#12463;&#12522;&#12483;&#12463;&#12391;&#12450;&#12488;&#12512;&#12398;&#22266;&#23450;
-- &#38750;&#34920;&#31034;&#12398;&#33180;&#12434;&#12480;&#12502;&#12523;&#12463;&#12522;&#12483;&#12463;&#12391;&#33180;&#12398;&#22266;&#23450;
--- &#33180;&#12398;&#20013;&#12398;&#12494;&#12540;&#12489;&#12418;&#22266;&#23450;&#12373;&#12428;&#12427;&#12383;&#12417;&#12289;&#34920;&#31034;&#35373;&#23450;&#12395;&#12375;&#12383;&#12392;&#12365;&#12395;&#12399;&#20013;&#12398;&#12494;&#12540;&#12489;&#12418;&#22266;&#23450;&#12373;&#12428;&#12390;&#12356;&#12427;
-- &#34920;&#31034;&#12398;&#33180;&#12434;&#12480;&#12502;&#12523;&#12463;&#12522;&#12483;&#12463;&#12391;&#33180;&#12395;&#21547;&#12414;&#12428;&#12427;&#12494;&#12540;&#12489;&#12434;&#20840;&#12390;&#22266;&#23450;
- &#12489;&#12521;&#12483;&#12464;&#12391;&#12494;&#12540;&#12489;&#12398;&#31227;&#21205;&#12364;&#34892;&#12360;&#12427;
-- &#12489;&#12521;&#12483;&#12464;&#20013;&#12398;&#12494;&#12540;&#12489;&#12399;&#21147;&#23398;&#30340;&#24433;&#38911;&#12434;&#21463;&#12369;&#12394;&#12356;
- &#12394;&#12395;&#12418;&#12394;&#12356;&#37096;&#20998;&#12434;&#12489;&#12521;&#12483;&#12464;&#12377;&#12427;&#12392;&#20840;&#20307;&#12434;&#31227;&#21205;&#12377;&#12427;
*** &#12525;&#12464;&#12497;&#12493;&#12523;&#65288;&#19979;&#37096;&#12398;&#12497;&#12493;&#12523;&#65289;
&#23455;&#34892;&#20013;&#12398;&#29366;&#24907;&#12434;&#12486;&#12461;&#12473;&#12488;&#12505;&#12540;&#12473;&#12391;&#34920;&#31034;&#12290;&#12383;&#12384;&#12375;&#12289;&#19990;&#30028;&#33180;&#12418;&#34920;&#31034;&#12373;&#12428;&#12390;&#12375;&#12414;&#12358;&#12398;&#12391;&#27880;&#24847;&#12290;
**Function List [#jb6fc82e]
&ref(unyo_ss.jpg);
***1: Menu Bar [#z9cd180e]
''File:''~
:''Open File(Ctrl+O):''| open a program file.
:''Save Graph Image(Ctrl+I):''|
:''Restart(F11):''|

*** &#12467;&#12531;&#12488;&#12525;&#12540;&#12523;&#12497;&#12493;&#12523;&#65288;&#21491;&#12398;&#12497;&#12493;&#12523;&#65289;
- Go ahead&#12391;&#21453;&#24540;&#12434;&#36914;&#12417;&#12427;
- Show All&#12391;&#20840;&#12390;&#12398;&#33180;&#12434;&#34920;&#31034;&#35373;&#23450;&#12395;&#12377;&#12427;
- Hide All&#12391;&#20840;&#12390;&#12398;&#33180;&#12434;&#38750;&#34920;&#31034;&#35373;&#23450;&#12395;&#12377;&#12427;
- Divergence&#12391;&#25152;&#23646;&#33180;&#12398;&#20013;&#24515;&#12363;&#12425;&#21453;&#30330;&#12377;&#12427;&#21147;&#12434;&#21463;&#12369;&#12427;
-- &#19990;&#30028;&#33180;&#12363;&#12425;&#12418;&#24433;&#38911;&#12434;&#21463;&#12369;&#12427;&#12383;&#12417;&#12289;&#33180;&#12395;&#25152;&#23646;&#12375;&#12390;&#12356;&#12394;&#12356;&#12494;&#12540;&#12489;&#12418;&#24433;&#38911;&#12434;&#21463;&#12369;&#12427;
-- &#23455;&#34892;&#20013;&#12399;&#27531;&#12426;&#23455;&#34892;&#26178;&#38291;&#12434;&#24038;&#19978;&#12395;&#34920;&#31034;&#12377;&#12427;
-- &#23455;&#34892;&#12377;&#12427;&#12383;&#12403;&#12395;&#23455;&#34892;&#26178;&#38291;&#12364;100&#12378;&#12388;&#21152;&#31639;&#12373;&#12428;&#12427;&#12290;
--- 100&#12399;100&#12473;&#12486;&#12483;&#12503;&#12398;&#24847;&#21619;
-- &#23455;&#34892;&#20013;&#12418;Attraction&#65288;&#24341;&#21147;&#65289;&#20197;&#22806;&#12398;&#21147;&#23398;&#30340;&#24433;&#38911;&#12434;&#21463;&#12369;&#12427;
--- &#12424;&#12426;&#30330;&#25955;&#12373;&#12379;&#12383;&#12356;&#22580;&#21512;&#12399;&#20182;&#12398;&#21147;&#23398;&#12514;&#12487;&#12523;&#12398;&#35336;&#31639;&#12434;&#20999;&#12387;&#12383;&#26041;&#12364;&#33391;&#12356;
- Stop Divergence&#12391;&#30330;&#25955;&#20966;&#29702;&#12434;&#25171;&#12385;&#20999;&#12427;
- Show Link Number&#12395;&#12481;&#12455;&#12483;&#12463;&#12364;&#20837;&#12387;&#12390;&#12356;&#12427;&#12392;&#12289;&#12522;&#12531;&#12463;&#12398;&#24341;&#25968;&#30058;&#21495;&#12364;&#34920;&#31034;&#12373;&#12428;&#12427;
- Calc Angle&#12395;&#12481;&#12455;&#12483;&#12463;&#12364;&#20837;&#12387;&#12390;&#12356;&#12427;&#12392;&#35282;&#35299;&#20687;&#24230;&#65288;&#26368;&#23567;&#12398;&#35282;&#24230;&#65289;&#12434;&#22823;&#12365;&#12367;&#12377;&#12427;&#21147;&#12434;&#21152;&#12360;&#12427;
- Calc Spring&#12395;&#12481;&#12455;&#12483;&#12463;&#12364;&#20837;&#12387;&#12390;&#12356;&#12427;&#12392;&#12496;&#12493;&#12514;&#12487;&#12523;&#12398;&#21147;&#12434;&#12522;&#12531;&#12463;&#12395;&#25345;&#12383;&#12379;&#12427;
- Calc Replusive&#12395;&#12481;&#12455;&#12483;&#12463;&#12364;&#20837;&#12387;&#12390;&#12356;&#12427;&#12392;&#12289;&#21508;&#12494;&#12540;&#12489;&#12364;&#37325;&#12394;&#12425;&#12394;&#12356;&#12424;&#12358;&#12395;&#21147;&#12434;&#21152;&#12360;&#12427;
- Calc Attraction&#12395;&#12481;&#12455;&#12483;&#12463;&#12364;&#20837;&#12387;&#12390;&#12356;&#12427;&#12392;&#12289;&#25152;&#23646;&#33180;&#12398;&#20013;&#24515;&#12392;&#24369;&#12356;&#12496;&#12493;&#12391;&#32080;&#12403;&#24341;&#21147;&#12434;&#21152;&#12431;&#12360;&#12427;
- &#12473;&#12521;&#12452;&#12480;&#12540;&#12391;&#25313;&#22823;&#32302;&#23567;&#12434;&#34892;&#12358;
''Edit:'' now being developed...

''Zoom(Scroll wheel, Ctrl++(;), Ctrl+-):'' change the scale of the graph.

''View:''
:''Show Map(Ctrl+M):''|show the whole graph.
:''Antialiasing:''|
:''Monochrome Display:''|
:''Show Full Name:''|show full name of atoms or membranes.
:''Show Initials:''|show initials of atoms or membranes.
:''Hide Name:''|hide name of atoms or membranes.
:''Show Reaction Point:''|show reaction points of the graph.
:''Show Link Number:''|
:''Info Font Size:''|

***2: Graph Controller [#naa78501]
:''Until Stop:''|make the program proceed until it terminate, or is suspended by '''"Stop"''' button, or break at a breakpoint.
:''Go Ahead:''|perform one-step reduction by default. For multi-step reductions, change the number in the text box to the left.
:''Stop:''|suspend the running program.
:''Hide All:''|hide the contents of all cells.
:''Show All:''|show the contents of all cells.
:''Always Heating Up:''|always calculate the graph layout.
:''Heating Up:''|activate the stable state nodes temporarily, and restart calculating those layout.
:''Cool Down:''|inactivate nodes, and terminate calculating layout.
:''Auto Centering:''|move the whole graph in the center of the Graph Panel.

***3: Tab Panel [#p6fe0100]
:''Log:''|show the system log.
:''Process:''|show the text representation of the graph and the applied rule. 
:''Rule:''|show the rules in the membrane you click.
:''Option:''|change the graph layout algorithm.
:''Shape:''|change the shapes of atoms.
:''Breakpoint:''|set breakpoints.
:''Search:''|search nodes in the Graph Panel.

***4: Graph Panel [#q1f93242]
:''Drag:''|move the selected nodes.
:''Click:''|select a node, if it is at the point.~
:''Ctrl+Click:''|select/unselect the nodes.~
:''Ctrl+A:''|select all of the nodes.~
:''Shift+Drag:''|select/unselect the nodes in the framed rectangle by dragging.~
:''Space+Drag:''|move the graph.~
:''Double-Click:''|hide/show the contents of the double-clicked cell.
:''Right-Click:''|
::''Hold:''|pin down the selected nodes.(Pinned-down entities can be moved manually but will not move automatically)~
::''Release:''|release the pinned-down nodes.~
::''Ravel Out:''|exert repulsive force from the center of the connected component which contains selected nodes.~